小兒推拿作為中醫傳統療法，是以中醫的基礎理論為指導，所以學習小兒推拿一定要鉆研中醫基礎理論，以及中醫兒科的基礎理論，用以指導臨床，以減少推拿治病和保健的盲目性。
辨證與論治
辨證論治是最具中醫特色的診斷、治療和預防疾病的原則。中醫診治疾病，不單著眼于“病”的異同，更要放在疾病不同“證”的個性上，要通過辨證來認識疾病和病證。人和各種疾病的表現，雖有其共性，但更多的是其個性。例如感冒，可發生在老人、小兒、產婦、青壯年等不同人群，引起該病的病因、發生的季節和機體反應的癥狀也不同。所以要求從事醫療和保健的工作者，做到精于辨證、靈活施治。
精于辨證
辨證是論治的前提和依據，是治愈疾病的關鍵。若辨證失誤，風寒感冒選用清天河水、退下六腑等寒性的穴位治療，不但無效反而會加重病情。
精于辨證，是一個長期實踐的過程。首先應運用好望、聞、問、切四診來收集資料。診治小兒疾病，應掌握以望診為主的特點。中醫辨證的綱領很多，其中八綱(陰、陽、表、里、寒、熱、虛、實)是最基本的綱領，而陰、陽又是綱中之綱。表、里辨別疾病部位的深淺;寒、熱辨別患者體質和病邪的屬性;虛、實辨別患者邪正雙方的盈虧。
靈活論治
論治是根據辨證結果，確定治療原則和方法，包括治法、選方(穴)、用藥(手法)。既可以單獨選用中藥方劑加減治療，也可選擇其他方法，如推拿、針刺、刮痧、拔罐等，亦可綜合多種療法治療。治療小兒疾病運用多種療法(雜合以治)，在具有同等療效的情況下，小兒推拿最為簡便、安全、舒適。因為它不受其他很多條件的限制，只要醫者的雙手健全，隨時隨地都可進行操作。如同中藥方劑治療疾病一樣，推拿治療選用手法和取穴亦需靈活。既可以“同病異治”，也可以“異病同治”，而不拘泥書本刻板套用。
同病異治：是指同一種病，在不同人和疾病的不同階段，表現的癥狀常不相同。如肺炎患者，在其初期、中期、恢復期表現的癥狀是不同的，所以需要根據病程、病情的變化，及時更換不同推拿手法來治療。初期以宣肺為主，推拿選一窩風、推肺經、拿肩井等;中期清肺為主，選掌小橫紋、總筋、清肺經等;后期以養肺為主，取補肺經、補脾經、補腎經、揉二馬等。
異病同治：是指不同的疾病，如感冒、氣管炎、肺炎等，因為都有咳嗽的癥狀，只要其癥狀的寒、熱、虛、實的性質相同，就可以用相同的手法來治療。寒者選揉一窩風、揉外勞宮、推上三關等;熱者選清心經、清肝經、清天河水等;虛者選補腎經、補脾經、揉二馬等;實者選清天河水、退下六腑、順時針摩腹等。
因時制宜：醫者，用藥勿犯天時寒熱溫涼之氣。比如在冬季和夏季選用發汗藥和推拿穴位，其計量和推拿手法的力度就不一樣，冬季人體汗孔緊閉、夏季汗孔較冬季疏松，所以冬季用藥的劑量和推拿手法的力度要大于夏季。
因地制宜：指在治療時必須根據不同的地域，選擇不同的治法或不同的用量，而不能一概而論。比如北方人較南方人肌肉緊實，所以給北方人用藥劑量和推拿手法的力度要大于南方人。
因人制宜：治病必需因人而異。因人有男女、老幼、大小、高矮、胖瘦等之別，所以在治療上，要有所區別。如老人和小兒用藥的劑量和推拿手法的力度均要小于成人和壯年等。如果不因人制宜，也會造成治療上的失誤。
小兒推拿療法適用于大部分兒科病癥，其中相當部分病癥療效極佳，在各種適宜技術中，完全可以作為首選療法應用。但不能忘記小兒發病容易，傳變迅速，必須把握病證寒熱虛實的迅速轉化。不能不分病癥推拿，也不能忘記小兒推拿的禁忌病癥。對于嚴重感染性疾病、傳染病等，或是全身出現衰竭的嚴重疾病，應采取綜合救治措施，而不能單獨運用推拿治療。如果不識病癥往往會貽誤病情。
傳承與創新
推拿是中國古老的、特有的防治疾病的有效方法之一，是一種綠色的自然療法、整體療法。
學習、研究小兒推拿，首先要傳承。傳承方式主要可以分為兩類：第一類是理論傳承，就是老師把中醫傳統的理論和個人的感悟傳授給學生誦讀和學習，學生接受和領悟。第二類是實踐傳承，就是老師把實踐的經驗手把手地傳授給弟子，以引導學生自己實踐。傳承要求做到對中醫及小兒推拿的古籍文獻、名家醫案和名老中醫的學術思想、臨床經驗和技術以及對各種民間技術進行整理、挖掘和研究。
學習、研究小兒推拿，不僅要傳承，更要創新。創新是在傳承基礎上的突破和超越。對于小兒推拿來說，山東地區小兒推拿三大流派，也是在小兒傳統推拿理論和實踐的基礎上，傳承和創新出來的。小兒推拿的取穴(穴位)和手法(操作)都有不少可以創新之處。臨床發現，搓摩小兒手指、手掌能改善小兒的甲襞微循環，所以可以將這一手法作為每次小兒推拿的結束手法，以增強其療效。
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